转录辅助因子对不同类型的核心位点具有特异性

2022-01-31 01:22:16 来源:

特异性辅助表征（transcriptional cofactor， COF）在增强子与性状表达两者之间传递调控线索，是特异性应答和性状表达的基本现像物。虽然已确认某些COF比其他COF愈来愈倾向某些性状表达型式，但是并不相同COF对并不相同性状表达结果显示出的内在抗原的相对尚不相符。在一项新的深入研究之中，来自奥地利维也纳生物之中心分子可病理学深入研究所的深入研究职员在黑腹果蝇S2细胞之中运用于高通量性状表达活性测定来筛选23个COF应答7.2万个候选基本性状表达（core promoter， CP）的能力。系统性深入研究结果于2019年5月15日在线发表在Nature季刊上，学术著作标题为“Transcriptional cofactors display specificity for distinct types of core promoters”。这些深入研究职员判读到基本性状表达的差异应答，这证明COF与特定型式的基本性状表达两者之间假定着并不相同的恒定倾向或者说“兼容性（compatibilities）”。这些功用并不相同的基本性状表达在TATA包、上游性状表达电容（downstream promoter element， DPE）和TCT基序等据信的序列电容上差异性地富集，并在介导位点上结果显示出并不相同的染色质特性。都有的是，这些基本性状表达型式在它们的H3K4me3和H3K4me1标记上假定并不相同的相对丰度，这证明这些核酸润色可能能够区分反式恒定表征而不是性状表达和增强子型式的环己烷恒定电容。这些深入研究职员确认在人细胞和另外两种果蝇细胞之中确认了并不相同COF-基本性状表达兼容性的假定。为此，他们推断出了分别倾向TATA包和CpG火山岛性状表达的COF。COF和基本性状表达两者之间的并不相同兼容性能够解释并不相同的增强子如何抗原地应答并不相同组的性状、相同性状内的可变性状表达（alternative promoter）和相同性状表达内的并不相同特异性都是在位点。综上所述，COF-基本性状表达兼容性可能是果蝇和生命等并不相同物种之中并不相同特异性程序的基础。独有出处：Haberle V1， Arnold CD1， Pagani M1， et al.Transcriptional cofactors display specificity for distinct types of core promoters.Nature. 2019 May 15. doi： 10.1038/s41586-019-1210-7. [Epub ahead of print]